Selama pemeriksaan kesehatan tahunan salah satu jenis medical check-up untuk remaja yang penting dilakukan adalah melakukan pemeriksaan fisik. Pada prosedurnya, ada beberapa aspek yang akan diperiksa oleh dokter. Mulai dari memeriksa tinggi dan berat badan remaja, tekanan darah, hingga indeks massa tubuh. Kemudian, dokter akan mendengarkan detak jantung dan paru-paru anak remaja. Dokter juga akan meraba kelenjar getah bening dan kelenjar tiroid di leher serta limpa, hati, dan ginjal di area perut.

Pemeriksaan fisik biasanya akan dilanjutkan dengan pemeriksaan alat kelamin. Pada anak remaja laki-laki, dokter akan memeriksa testis untuk mendeteksi adanya benjolan yang tidak biasa. Sementara itu, pemeriksaan kelamin pada remaja perempuan akan dilakukan dengan pemeriksaan panggul dan payudara. 

Uji sendi dan otot untuk fleksibilitas dan kekuatan juga akan dilakukan guna mendeteksi kelainan pada dua bagian tersebut. Terakhir, medical check-up juga akan dilakukan dengan pengujian kulit untuk mengetahui kondisi keparahan jerawat, dan memeriksa tahi lalat yang tidak normal.